John Byington nasceu em Vermont, filho de um pregador Metodista que havia servido como soldado no exército Revolucionário, que lutou pela independência Americana da Inglaterra. John foi batizado na Igreja Metodista aos 17 anos de idade. Pouco depois, recebeu uma licença para pregar como pregador leigo.
Após mudar-se para o estado de Nova Iorque, ajudou a construir uma casa de culto para a Igreja Metodista por volta de 1837 em Buck’s Bridge. Envolveu-se profundamente com o movimento da anti-escravatura, que eventualmente levou a um cisma na Igreja Metodista. John uniu-se à Igreja Metodista Wesleyana, e auxiliou a erigir o prédio da igreja, bem como a casa pastoral em Morley.
Em 1844, John assistiu a sermões sobre a iminente vinda de Cristo, e começou a estudar as profecias. Em 1852, H. W. Lawrence deu-lhe uma cópia da Review and Herald, contendo artigos sobre o Sábado do sétimo dia. Ele aceitou a verdade do Sábado antes que terminasse o ano, e foi batizado. Ajudou a construir a primeira igreja Adventista guardadora do Sábado construída para esse propósito. Tiago e Ellen White convidaram a família Byington para mudar para Battle Creek em 1858. John comprou uma fazenda ali por perto, e, de lá, viajava para ministrar aos crentes dispersos. Em 1863, com a idade de 65, aceitou ser o primeiro presidente da recém-organizada Igreja Adventista do Sétimo Dia. Trabalhou como um verdadeiro pastor durante seu mandato. Então, retornou a sua fazenda, mas continuou a visitação aos membros por todo o estado de Michigan nos 22 anos subsequentes. “Eu preciso alimentar os cordeiros do rebanho,” escreveu.